蛮横、不可预期的入侵者突袭了驻守慕尼黑的GDI部队，让GDI部队毫无招架之力。这场战争在开始之前就已决定了结果。入侵者冷酷无情席卷整个慕尼黑，你必须重整生还的GDI部队——那些在城市外围巡逻的部队，接着背水一战，拖延敌军的攻势，让那些GDI的F-T研究所的工程师们逃脱。这些工程师对这些入侵者有很重要的资讯，务必要保证他们的安全。